由于超低溫凍干機中蒸發器和冷凝器在長時間工作下會產生大量灰塵，導致冷氣與熱量的散發受到一定影響，使其程序制冷或制熱效果減弱的現象，并消耗大量的電能和時間。當啟動時，它內部的細菌會被吹到室內，對人體造成一定的傷害，尤其在夏季這種細菌滋生比較多的時候，如果不及時清理，會吸附大量灰塵、以及螨蟲、花粉、虱子和霉菌。
對于一款應用設備關鍵的內部清洗方法來說，首先務必要統一引起每位作業運營商的注意，進而來有效保證該款設備的良好運用性，因為相較于表面清洗方法來說，往往關鍵的內部清洗則是十分重要的。
超低溫凍干機內部潮顯高溫的壓縮空氣流入前置冷卻器散熱后流入熱交換器與從蒸發器排出來的冷空氣進行熱交換，使進入蒸發器的壓縮空氣的溫度降低。換熱后的壓縮空氣流入蒸發器通過蒸發器的換熱功能與制冷劑熱交換，壓縮空氣中的熱量被制冷劑帶走，壓縮空氣迅速冷卻，潮顯空氣中的水份達到飽和溫度迅速冷凝，冷凝后的水份經凝聚后形成水滴，經過*氣水分離器高速旋轉，水分因離心力的作用與空氣分離，分離后水從自動排水閥處排出。經降溫后的空氣壓力露點可達2℃。
降溫后的冷空氣流經空氣熱交換與入口的高溫潮顯熱空氣進行熱交換，經熱交換的冷空氣因吸收了入口空氣的熱量提升了溫度，同時壓縮空氣還經過冷凍系統的二次冷凝器與高溫的冷媒再次熱交換使出口的溫度得到充分的加熱，確保出口空氣管路不結露。同時充分利用了出口空氣的冷源，保證了幾臺冷凍系統的冷凝效果，確保了機臺出口空氣的質量。